公眾號商城和小程序商城的區別如下：

1、進入方式

小程序可以直接搜索進入商城，也可以鏈接至公眾號底部，通過微信公眾號的底部菜單進入，還可以搜一搜查找進入，多種方式進入。公眾號商城一般是通過公眾號的底部菜單、會話框和朋友圈分享鏈接，進入微信商城，雖然也可以通過掃一掃進入公眾號在進入商城，但是操作步驟上會稍繁瑣一些。

2、流量入口

小程序流量入口眾多，不僅能夠與公眾號對接，將公眾號作為流量入口外，還擁有附近小程序、搜一搜、朋友分享、群分享等眾多入口。公眾號商城主要的流量入口主要是公眾號菜單欄、朋友圈、搜一搜等，流量入口較少。

3、運營方式

小程序可以直接使用促銷活動，借助附近的小程序、搜索等功能觸達用戶，進入小程序中即可了解活動下單購買，營銷線路更短。公眾號商城在關注粉絲的基礎上進行營銷，主要利用公眾號發布軟文，或者營銷活動，然后再將進一步導流到商城。

4、留存效果

小程序有著比較好的用戶留存的效果，用戶在使用過之后，可以通過微信下拉框、搜一搜等多種渠道，再次找到微信小程序，但是微商城的留存效果相對來說不如小程序的效果好，用戶一旦離開，只能通過微信公眾號這一種方式再次找到。

以上是公眾號商城和小程序商城的一些區別，根據實際的需求和場景，選擇適合的商城類型是更重要的。